Assifero è amministrata da un Consiglio Nazionale composto, oltre che dalla Presidente, da ventuno membri eletti dall’Assemblea dei soci per la durata di quattro esercizi. 

Il 19 maggio 2021 l’Assemblea annuale dei soci ha votato il rinnovo degli organi associativi, ma anche il passaggio di testimone alla Presidenza tra Felice Scalvini, fondatore e promotore dell’associazione, nominato all’unanimità Presidente Onorario, e Stefania Mancini, Consigliere Delegato di Fondazione Charlemagne e già Vicepresidente Vicario di Assifero, eletta Presidente all’unanimità.